Además de los diversos programas estables de CONICYT, la institución ha diseñado una unidad independiente y especializada, destinada a la formación de recursos humanos. Este departamento posee las siguientes líneas de acción:

Una a través de la que se promueve la formación de recursos humanos con estudios avanzados dentro del Sistema Universitario Nacional, tendiendo a la ampliación de la educación de postgrado, en especial en el ámbito doctoral.

Existe otra línea que apoya la formación de postgrados en países con los que Chile tiene convenios de cooperación. Además apoya la formación de postgrados en el extranjero, en áreas emergentes o actualmente deficitarias en el país.

Este departamento administra los programas de Becas otorgadas por CONICYT y actúa como Secretaría Técnica de la Comisión Nacional de Acreditación (CNA).

Programas, qué ofrecen y cuáles son sus beneficiarios

Los beneficios de becas de los siguientes programas se obtienen a través de postulación a cada llamado a concurso.

PROGRAMA NACIONAL DE BECAS DE POSTGRADO:
Destinado a financiar los estudios conducentes a la obtención de los grados académicos de Doctor y Magister de profesionales jóvenes chilenos o extranjeros con residencia definitiva en Chile, licenciados o con título profesional equivalente, en Universidades Chilenas.

El programa es complementado con becas financiadas por la Cooperación Internacional, que permite que los becarios realicen estadías en el extranjero durante el período de su beca.

Los convenios hasta hoy vigentes son:

• Convenio DAAD/CONICYT: Becas para estadías de investigación por un periodo máximo de 10 meses en universidades alemanas, a estudiantes de programas de doctorado que ya poseen beca CONICYT y que se encuentran en etapa de desarrollo de tesis, con proyecto de tesis aprobado.
• Convenio FULBRIGHT/CONICYT: Concurso de apoyo para estadías de investigación en universidades de los Estados Unidos a becarios CONICYT de programas de doctorado que se encuentran con el proyecto de tesis aprobado y en el desarrollo de la misma.
• Convenio FULBRIGHT/CONICYT: Programa de becas de doctorado, cuya finalidad es apoyar a estudiantes chilenos que desean obtener el grado de Doctor en áreas científicas y tecnológicas en universidades estadounidenses.
• Convenio ECOS/CONICYT (Francia): Becas de doctorado en co-tutela para estudiantes chilenos que forman parte de un proyecto ECOS/CONICYT y que están cursando el doctorado con una beca nacional CONICYT.
  

PROGRAMA BECAS DE APOYO PARA REALIZACIÓN DE TESIS DOCTORAL:
Su objetivo principal es financiar proyectos de investigación de uno a tres años de duración, que permita a estudiantes de doctorado de universidades chilenas y en programas acreditados por la Comisión Nacional de Acreditación (CNA), realizar el trabajo de investigación que forme parte integral de su tesis doctoral, contribuyendo de esta manera a la formación de científicos y profesionales altamente especializados.

PROGRAMA BECAS TÉRMINO DE TESIS DOCTORAL:
Este programa permite a los estudiantes de doctorado de las universidades chilenas, de Programas acreditados por la Comisión Nacional de Acreditación (CNA), completar el trabajo de investigación necesario para obtener el grado académico de doctor en las áreas de ciencia y de investigación tecnológica. A través de estos proyectos, que tienen una duración máxima de un año, pueden dedicarse en forma exclusiva a la investigación y redacción de su tesis.

PROGRAMA DE BECAS DEL CONVENIO GOBIERNO DE CHILE -BID:
Programa de Becas de Postgrado: El objetivo del Programa es financiar a chilenos o extranjeros con residencia definitiva en Chile , para proseguir estudios que conducen a la obtención de grados académicos de Doctor y Magister en universidades extranjeras en las áreas de: biotecnología de las ciencias forestales, agropecuarias y acuícolas; tecnologías de la información y comunicación y producción limpia.

Programa de Pasantías Tecnológicas:
El programa busca financiar a jóvenes emprendedores chilenos o extranjeros con residencia definitiva en Chile para realizar pasantías tecnológicas en instituciones públicas o privadas en el extranjero, para lograr conocimientos respecto de una técnica o tecnología específica que sea determinante para el desarrollo de un proyecto de tecnologías de la información y comunicaciones.

PROGRAMAS DE BECAS DE MASTER INVESTIGACION Y DOCTORADO:
Este programa convocado en conjunto por la Comisión Nacional de Investigación Científica y Tecnológica CONICYT y el Servicio de Cooperación y de Acción Cultural de la Embajada de Francia en Chile, tiene como propósito otorgar becas a estudiantes, para la obtención del DEA (Diploma de Estudios Avanzados o Master) y luego del Grado académico de Doctor en Universidades o "Grandes Ecoles" francesas. Estas becas están orientadas hacia la formación de académicos y/o investigadores, y están abiertas a todas las áreas y tienen una duración máxima de 48 meses, privilegiando aquellos Programas de doctorado que no se encuentren acreditados en el país por la Comisión Nacional de Acreditación (CNA).

CONCURSO PARA ASISTENCIA A CONGRESOS Y CURSOS CORTOS EN EL EXTRANJERO:
Tiene por objetivo apoyar la formación de estudiantes de Programas de Doctorado y Magister acreditados por la CNA, mediante el financiamiento para la asistencia a Congresos o Cursos cortos realizados en centros de investigación extranjeros.

DEPARTAMENTO DE RELACIONES INTERNACIONALES:
Tiene como misión la implementación y gestión de la política sobre cooperación internacional desarrollada por CONICYT, con el propósito de fomentar la integración de la comunidad científica nacional con sus pares en todo el mundo, así como vincular la labor de la institución con organismos nacionales e internacionales del ámbito de la ciencia y la tecnología.

Qué ofrece y cuáles son sus beneficiarios:

Cooperación Bilateral
CONICYT favorece e impulsa la vinculación de la comunidad científica nacional con sus pares internacionales, sobre la base de la excelencia científica mutua y tomando en consideración los intereses de ambas partes, a través de 30 acuerdos interinstitucionales suscritos a la fecha entre CONICYT y sus contrapartes de América, Asia, Europa y Oceanía. Los mecanismos de cooperación más frecuentes, que originan cooperación Sur-Sur y cooperación Norte-Sur en igualdad de condiciones, y cuyo financiamiento es compartido, son:

• Movilidad e intercambio de investigadores en el marco de proyectos conjuntos de investigación.
• Estadías de perfeccionamiento en el extranjero, que permiten que estudiantes de doctorado realicen pasantías de hasta 18 meses en laboratorios especializados. Asimismo, estos instrumentos contemplan pasantías cortas para jóvenes investigadores chilenos.