Los actores involucrados en el marco institucional en el cual CONICYT ejecuta su estrategia son los siguientes:

a. Redes horizontales (socios): son todos aquellos agentes, ya sea públicos o privados, que desarrollan actividades complementarias a CONICYT, y con los cuales se pueden desarrollar acciones que permitan aprovechar eficientemente las oportunidades presentes en el sistema de innovación. Entre éstos se encuentran:

1. Corporación de Fomento de la Producción (CORFO).
2. Ministerio de Economía.
3. Subsecretaría de Desarrollo Regional y Administrativo (SUBDERE).
4. Ministerio de Planificación (MIDEPLAN).
5. Academia Chilena de Ciencias.
6. Sociedad de Fomento Fabril (SOFOFA).
7. MICROSOFT.
8. Empresas nacionales o internacionales.

b. Redes verticales: son todos agentes con los cuales CONICYT posee una relación formal y establecida para el logro de sus funciones. Éstos se pueden diferenciar como:

b.1. Autoridades: Ministerio de Educación, Dirección de Presupuestos del Ministerio de Hacienda (DIPRES), Consejo Nacional de Innovación para la Competitividad (CNIC).

b.2. Beneficiarios: universidades, personas naturales (estudiantes y becarios), investigadores, académicos, científicos, centros de investigación y empresas, entre otros.