El 95% del presupuesto de CONICYT para el año 2008 corresponde a transferencias para fomentar la Ciencia y Tecnología en el país y apenas un 5% se destina a gastos de operación.

Se presenta a continuación la evolución del presupuesto de CONICYT para el período 2004-2008:

Fuente: Departamento de Administración y Finanzas de CONICYT.

El incremento en el presupuesto total de CONICYT para los años 2006-2008 se explica principalmente por los recursos provenientes del Fondo de Innovación para la Competitividad (FIC).