Desde su creación en 1992, Fondef estableció que el potencial de transferencia de los resultados o transferencia tecnológica de un proyecto de investigación y desarrollo (I+ D) era uno de los 3 conjuntos de criterios para la selección y adjudicación de proyectos. Se suponía en esa época que se realizarían actividades de transferencia como parte de la ejecución del proyecto. En 2002, FONDEF crea el Programa de Transferencia Tecnológica, para contribuir a que los resultados de los proyectos de I + D efectivamente produjeran impactos económicos-sociales. En este Programa se financia la transferencia tecnológica de los resultados de los proyectos FONDEF de I + D a los sectores económicos y sociales. El programa financia la ejecución de proyectos de transferencia de conocimientos resultantes de proyectos de investigación científica o de investigación y desarrollo ejecutados y financiados por CONICYT. Cada proyecto tiene 2 etapas:
- Etapa I: Elaboración de un plan de negocios que permita evaluar el potencial económico-social del conocimiento que se pretende transferir y de un plan de trabajo para la transferencia de ese conocimiento.
- Etapa II: Ejecución del plan de trabajo para la transferencia del conocimiento.
El aporte máximo de Fondef es de hasta $ 60 millones de pesos por proyecto presentado por instituciones elegibles, y de un máximo de $40 millones por proyecto presentados por personas naturales. El aporte de Fondef es de un máximo de 6 millones de pesos para la Etapa I. Para la Etapa II, el beneficiario potencial podrá optar al monto máximo del subsidio descontando lo adjudicado en la Etapa I. | 
