En el ámbito de la ciencia, la tecnología y la innovación (CTI), el Gobierno realiza principalmente tres acciones claves y claramente diferenciadas; por un lado es el estamento que formula las Políticas del Sistema de Ciencia, Tecnología e Innovación, desarrolla además gran porcentaje de la investigación nacional, fundamentalmente a través de organizaciones dependientes de ministerios y otras entidades autónomas y descentralizadas y cumple un rol fundamental en el financiamiento de gran parte de la investigación de las empresas y de las universidades a través de aportes directos o de fondos concursables. Parte del sector gobierno percibe también aportes del extranjero (Institutos). Realiza Prospección y Servicios y Formación de Personal C&T.
En cifras, al 2004 el 53 % del gasto en I+D en Chile es financiado por el sector público (US$345 MM), a través de fondos concursables, programas tecnológicos e instituciones gubernamentales asociadas directamente con actividades de I+D. Dentro de este porcentaje, también se consideran las transferencias directas que realiza a las universidades del consejo de rectores para investigación (US$123MM) y el financiamiento de las actividades de investigación de empresas públicas (35.511 MM$).
Del total de recursos en I+D financiados por el gobierno (210.466 MM$), el 17% financia actividades de investigación del sector empresas públicas. (35.511 MM$).
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