Resultados

Resultados Programa Genoma en Recursos Naturales Renovables

El monto global por línea de investigación del Programa, considerando los aportes de todas las instituciones participantes, ascendió a alrededor de seis millones de dólares para el período 2002-2005. Los proyectos fueron seleccionados por su impacto, los beneficios económicos y el posicionamiento internacional de los productos que mejorarán con esta iniciativa.

I. “Genómica funcional en nectarines: Plataforma para fomentar la competitividad de Chile en exportación de frutas”, dirigido por Ariel Orellana (ex investigador de la Universidad de Chile, actualmente de la Universidad Andrés Bello), busca controlar la harinosidad que afecta a los nectarines tras el proceso de almacenamiento en frío para su exportación. La iniciativa contó con la participación de las siguientes instituciones: la Universidad de Chile, el INIA, la Fundación Chile, la Asociación de Exportadores de Chile y la Fundación para el Desarrollo Frutícola. Consideró una inversión global de M$ 1.227.905.

Este proyecto  reporta los siguientes logros:

  • Generación de una base de datos de genes expresados, en nectarines normales y harinosos.
  • Detección de patrones de cambio en proteínas relacionadas con nectarines normales y harinosos.
  • Establecimiento de las bases del mejoramiento genético basado en la genómica funcional apuntando a la generación de nuevas variedades de nectarines y duraznos menos susceptibles al pardeamiento y enfriamiento.
  • Estudio del alcance de la patentabilidad de los resultados obtenidos (estudio de dos patentes sobre los resultados obtenidos).
  • Spin-off biotecnológico, APGENTECH LTDA., que prestará servicios genómicos en el área agrícola y otras. Esta empresa prestará servicios en el ámbito del estudio genómico relacionado con distintas especies.
  • Este proyecto fue invitado a participar del International Consortium for the Genome of the Rosaceae Family, instancia público–privada, liderada por EE.UU.
  • Dada la relevancia de los resultados obtenidos por el proyecto, Chile y el director del equipo investigador, Dr. Ariel Orellana,  fueron designados como país sede y organizador, respectivamente, del próximo encuentro  mundial de genómica en rosáceas a realizarse en marzo de 2008.

II. “Plataforma científico-tecnológica para el desarrollo de la genómica vegetal en Chile. Etapa I: Genómica funcional en vid”, dirigido por el investigador Hugo Peña (UTFSM), contó con la participación de  la Universidades Técnica Federico Santa María, de Chile, de Santiago y de Talca, el INIA, la Asociación de Exportadores de Chile, la Fundación para el Desarrollo Frutícola y la Fundación Chile. Contó con una inversión global de M$1.751.796. El objetivo es generar especies con mayor valor agregado para los mercados demandantes a través de la modulación de los procesos de crecimiento y maduración de las vides.

Este proyecto presenta los siguientes resultados:

  • Estudio de patentabilidad de un nuevo método de extracción de material genético de importancia selectiva extrapolable a otras especies de frutas y hortalizas.
  • Identificación de expresión diferencial de genes relacionados con los estados de desarrollo de la uva.
  • Nueva vía metabólica relacionada con el metabolismo de sustancias reguladoras del crecimiento en uva Carmenère.
  • Expresión diferencial de genes relacionados en el proceso de maduración en uva Sultanina y Carmenère para mesa y vino y la modificación de éstos en presencia de Botritys cinerea.

Solicitudes de patentes presentadas en Chile:

Materia                 N° de Solicitud

PR-gene               3072-05

Ankirinas              3073-05

SAMDC                 3074-05

GAG                     3075-05

wBOR                   3076-05

wZIP                    3077-05

wABC                    3078-05

Aquaporinas          3092-05

Genes GA              3093-05

  • El equipo de investigadores recibió una invitación para incorporarse al Comité Directivo del International Grape Genome Programme, donde participan como miembros Italia y Francia, entre otros.
  • Generación de dos tesis doctorales y capacitación en técnicas específicas para el manejo de gran número de genes a varios estudiantes de pregrado.
  • Este proyecto ha incorporado un 21% de nuevos genes en el ámbito de la uva al pool de información que se conoce y que ha sido depositada hasta ahora en el Genebank.
CLUSTER TYPE # OF CLUSTER PERCENT
DEGECHIVID 19738 42.5%
GENBANK 16556 35.7%
SHARED 10.118 21.8%
TOTAL 46412 100%

La información generada a través de este proyecto representa un 64 % de toda la información disponible a nivel mundial acerca de Vitis vinifera.

III. “Estudios genómicos y de expresión genética en vides: respuesta a la infección viral y desarrollo de sistemas de diagnóstico”. La iniciativa, dirigida por Patricio Arce (PUC), busca generar variedades más resistentes a ciertos patógenos que las afectan, así como también el desarrollo de sistemas de diagnóstico más precisos y ambientalmente limpios que permitan disminuir el uso de pesticidas y herbicidas. El proyecto contó  con la participación de la Pontificia Universidad Católica de Chile, la Universidad de Chile, la Fundaciónla Vida y Bios-Chile Ingeniería Genética S.A. Consideró una inversión global de M$1.096.396.

Los principales resultados de este estudio fueron:

  • Una patente presentada en Chile (N° 01837-2003) y EE.UU. para el proyecto de virus en vides.
  • Desarrollo de nuevos KITs de diagnóstico para virus que atacan la uva y que tienen gran incidencia en la industria del vino.
  • Kits desarrollados:

1-GLRaV-1 ELISA Detection kit

2-GLRaV-1 IC-RT PCR Detection Kit

3-GLRaV-3 ELISA Detection Kit

4-GLRaV-3 IC-RT PCR Detection Kit

  • Desarrollo de una metodología nacional de transformación genética para generar portainjertos y variedades de vides con mayor resistencia a virus u otras características de interés.
  • Generación de una base de datos pública que contiene modelos tridimensionales de numerosas proteínas de uva.
  • Diversos genes y promotores de vides que participan en procesos fisiológicos relevantes.
  • En término de generación de capacidades técnicas especializadas, se desarrollaron 6 tesis de pregrado en áreas de biotecnología, bioinformática y bioquímica. Además, una tesis de magister y 3 tesis doctorales.
  • Generación de publicaciones científicas y participaciones a congresos del área.
  • Los buenos resultados demostrados por el proyecto se han traducido en una invitación formal del Genome Plant Programme de la National Science Fundation (NSF), principal organismo científico del Gobierno de Estados Unidos, para  participar de un  consorcio que estudia mecanismos de estrés en Vitis vinífera.